طراحی ظاهری آیفون 16 بسیار شبیه به آیفون 15 است، اما تغییرات کوچکی در آن دیده می‌شود. لبه‌های این گوشی همچنان کمی خمیده طراحی شده تا در دست گرفتن آن راحت‌تر باشد. قاب پشتی دستگاه همچنان از جنس شیشه است و امکان پشتیبانی از شارژ بی‌سیم را فراهم می‌کند. با این حال، تغییر مهمی که در طراحی آیفون 16 به وجود آمده، مربوط به چینش لنزهای دوربین است؛ در این مدل، اپل لنزهای دوربین را به جای قرار دادن به شکل مورب، به صورت عمودی روی هم قرار داده است.

یکی دیگر از تغییرات در آیفون 16، اضافه شدن دو دکمه جدید به کناره‌های بدنه آن است. یکی از این دکمه‌ها، دکمه‌ی اکشن است که قبلاً تنها در مدل‌های پرو آیفون 15 دیده می‌شد و حالا در نسخه‌های معمولی آیفون 16 نیز حضور دارد. دکمه جدید دیگری که به آیفون 16 اضافه شده، دکمه حساس به فشار "Camera Control" است که به کاربران امکان کنترل دوربین را می‌دهد.

این دکمه "Camera Control" به‌طور هم‌سطح با بدنه کناری دستگاه طراحی شده و یک لایه از شیشه یاقوت کبود بر روی آن قرار گرفته است. با یک کلیک روی این دکمه، اپلیکیشن دوربین باز می‌شود و با کلیک مجدد، عکس گرفته می‌شود. اگر دکمه را نگه دارید و آن را رها نکنید، فیلم‌برداری شروع می‌شود. این دکمه همچنین با استفاده از بازخورد هپتیکی، کاربر را از عملکردهای مختلف خود آگاه می‌کند. علاوه بر این، دکمه "کنترل دوربین" می‌تواند بین فشار کامل و لمس آرام‌تر تمایز قائل شود؛ با لمس ملایم، کاربران می‌توانند پیش‌نمایش تصویر را ببینند یا با دو بار تپ کردن، به اطلاعات مربوط به زوم و عمق تصویر دسترسی داشته باشند.

آیفون 16 دارای یک صفحه‌نمایش 6.1 اینچی است که از نظر اندازه مشابه نسل قبلی خود است. این نمایشگر دارای یک لایه محافظ سرامیکی جدید است که نسبت به خط‌وخش و ضربه مقاوم‌تر شده و ادعا می‌شود که 50 درصد سخت‌تر از نسل قبلی و 2 برابر مقاوم‌تر از سایر گوشی‌ها است. حداکثر روشنایی این نمایشگر به 2000 نیت می‌رسد که تجربه کاربری بهتری را در محیط‌های پرنور فراهم می‌کند.

دوربین اصلی آیفون 16 با سنسور 48 مگاپیکسلی و فاصله کانونی 26 میلی‌متری طراحی شده است. این دوربین دارای پیکسل‌های چهارگانه 2 میکرونی و دیافراگم f/1.6 است و از لرزشگیر سنسور شیفت بهره می‌برد. این دوربین قادر است تصاویر 48 مگاپیکسلی را با تصاویر 12 مگاپیکسلی تلفیق کرده و عکسی با وضوح 24 مگاپیکسل و نور بیشتری تولید کند.

علاوه بر این، دوربین تله‌فوتو 12 مگاپیکسلی آیفون 16 با زوم دو برابری و فاصله کانونی 52 میلی‌متری در اختیار کاربران قرار دارد. همچنین، دوربین فوق‌عریض 12 مگاپیکسلی با فاصله کانونی 13 میلی‌متری و دیافراگم f/2.2 مکمل این سیستم عکاسی است.

اپل وعده داده که با افزایش ظرفیت باتری و بهینه‌سازی‌های انجام شده بر روی تراشه جدید، آیفون 16 از عمر باتری بهتری برخوردار است.

آیفون 16 مجهز به تراشه قدرتمند A18 Bionic است که با فناوری 3 نانومتری نسل دوم ساخته شده و از نظر پردازش، حدود 30 درصد سریع‌تر از تراشه A17 است. این تراشه 6 هسته‌ای شامل 2 هسته پرقدرت و 4 هسته کم‌مصرف است و در بخش موتور عصبی نیز 2 برابر سریع‌تر عمل می‌کند.